換気についての質問です。三階建ての場合、第三種換気(ルフロ400)と第一種換気(澄家)、どちらの方が適切に換気が出来ると思いますか?

機種による差よりも設計による差の方が大きいと思います。きちんと3層貫通した吹き抜けがあり、エコエアーシステムなどの、空気が循環できるオプションがしっかり施工されていれば澄家でも淀みなくできるのではないでしょうか。C値は良くしておくに越したことはありません。