太陽光パネルの後乗せを考えています。付加断熱をした場合、太陽光パネルの工事で気をつけなければならない事はありますか?気密処理が最近心配になってきましたので伺いたいです。

キャッチ工法などの穴を開けないやり方や、通気工法などの穴が開いても気密に影響しない屋根の作り方をしておくと良いかと思います。
PPAが使えるのであれば、わざわざ後乗せにしなくてもすぐつけてしまっても良いかと思いますので、それも含めて設計士さんと相談してみてくださいませ。