窓に対する断熱補強で、「内窓の設置」「窓の交換」がありますが、これらの工事は気密・水密は問題ないでしょうか?窓の部分強化で『内窓の設置』以外の選択肢はありますでしょうか?

内窓の設置、窓の交換、どちらも良いかと思いますが、いずれにしても、「後は窓だけ何とかすれば大丈夫」という状態の家でやるべき工事です。そもそもの断熱性能が足りていない家で、窓だけ何とかしても、結露は止まれど全体的な寒さは劇的には改善しません。窓を交換するのであれば、内装か外装を剥がして断熱補強も一緒にやるべきだとは思います。