珪藻土、漆喰の調湿効果が生かされるのは中間期です。

本当に湿気の多い梅雨～8月や、水分の絶対量が少ない冬は空調（加減湿含む）無くして快適にならないのは内装材を変えても同じです。

湿気の計算をされた高性能住宅は最低限無くては話になりません。それに加えて少し湿度変化がまろやかになるのが珪藻土や漆喰になります。どちらを選ぶかという話でもありません。